On retrouve des traces d'occupation humaine autour du lac Onéga, mais aussi à proximité du gisement de shungite de Zazhoginsky depuis le Néolithique. De nombreuses gravures rupestres en attestent. Il a été répertorié environ 1 300 pétroglyphes autour du lac, réparties sur 25 sites différents.
Ces pétroglyphes ont été inscrits sur la liste du Patrimoine mondial de l'UNESCO le 28 juillet 2011.
A ce jour, aucune preuve ne vient étayer l'utilisation de shungite par ces populations, mais il est avéré qu'elles fréquentaient régulièrement ces lieux.
Les premières traces historiques d'utilisation de la shungite remontent au Moyen-Âge. De nombreuses légendes locales évoquent cette pierre noire aux propriétés bénéfiques, elle était alors utilisée comme talisman pour attirer chance et protection.
En 1719, Pierre le Grand, Tsar de Russie, ordonne la construction de la première station balnéaire de Russie. Après avoir voyagé en Europe, Pierre le Grand a découvert l'efficacité des eaux thermales dans le traitement de son eczéma. Il lance à son retour en Russie une grande enquête nationale visant à recenser les différentes sources d'eaux thermales sur le territoire.
C'est finalement la Carélie qui est choisie pour ce projet, en raison d'un évènement ayant retenu l'attention des enquêteurs : des ouvriers travaillant dans une mine de fer non loin du village de shunga souffraient d'une intoxication. Les villageois les ayant découverts très malades et affaiblis, leur ont fait boire de l'eau de sources voisines. Les ouvriers ont alors été complètement rétablis en quelques jours.
Bien qu'elles soient situées très au nord de la Russie, les sources d'eau minérales retenues ne gèlent pas en hiver. Les géologues et chimistes du Tsar déterminèrent que ces eaux traversent un gisement de fer et de shungite, ce qui leur confère des propriétés particulièrement intéressantes sur la santé humaine. Les rumeurs locales sur l'efficacité de ces eaux sont confirmées.
La station sera nommée Martsialnye Vody : Les Eaux Martiales, en l'honneur du dieu romain Mars, dieu de la guerre et du fer.
Pierre le Grand visita la station à quatre reprises, pour une durée totale de trois mois, afin de soigner l'eczéma dont il était atteint. D'autres membres de la famille impériale y ont également séjourné. Après la mort de Pierre le Grand, d'autres stations thermales seront construites plus au sud, et au bout de quelques décennies, l'intérêt des tsars et des nobles pour la station de Martsialnye Vody diminue au profit des autres établissements, bénéficiant d'un climat plus doux.
Moins fréquentée par les notables, la station de Martsialnye Vody tombera peu à peu dans l'oubli, mais elle sera redécouverte et réhabilitée en 1964, et fonctionne toujours depuis. Elle a été agrandie à plusieurs reprises.
En 2003 la station balnéaire de Dvortsy a été construite à proximité, bénéficiant des mêmes sources thermales.
Aujourd'hui encore, Martsialnye Vody propose notamment de traiter l'anémie, l'hypertension, les affections rhumatismales, cardiaques, circulatoires, digestives, respiratoires, et diabétiques.
A partir des années 1960 et la réhabilitation de la station balnéaire de Martsialnye Vody, les populations locales recommencent à affluer pour bénéficier des bienfaits de ses eaux.
Face à cet engouement, des scientifiques russes se sont intéressés à la réputation croissante de la station thermale, et ont cherché à vérifier si les vertus curatrices des eaux thermales de shungite étaient dues à son influence ou si d'autres facteurs entraient en compte : en effet, ces eaux sont également très riches en fer, et les eaux ferrugineuses sont également très efficaces en elles-mêmes pour soigner certaines pathologies.
Les conclusions ont été sans appel : les bienfaits des eaux de shungite sont indéniables pour la santé. Des études soulignent le rôle impressionnant de l'eau de shungite dans l'aide à la cicatrisation des blessures et des brûlures, ainsi que le traitement des affections de peaux, des maladies rhumatismales, des pathologies des systèmes respiratoire et digestif, ou encore le diabète sont indéniables.
D'autres sanatoriums sont alors construits, et les scientifiques russes poursuivent leurs recherches en s'intéressant alors propriétés du minerai de shungite lui-même. De très nombreuses études scientifiques sont menées, que ce soit dans le domaine médical, agronomique, dans la physique... Ouvrant le pas à de nombreuses applications dans la vie courante.
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